党政管理机构
- 党委办公室、校长办公室
- 纪委办公室
- 党委组织部(党校)、机关党委
- 党委宣传(统战)部
- 党委巡察工作办公室
- 学生工作部(处)（大学生就业创业引导中心）
- 研究生院（研究生工作部）、学科建设办公室
- 党委教师工作部、人力资源处
- 安全保卫部（处）（武装部）
- 离退休工作处（关工委办公室）
- 工会
- 团委
- 国际合作与交流处（港澳台事务办公室）、国际教育学院
- 发展规划处(高教研究所)
- 教务处（教学质量监控与评价中心、教师教学发展中心、招生办公室）
- 科研处
- 财务处
- 资产与实验室管理处
- 审计处
- 基建管理办公室
- 校友工作处（教育发展基金会秘书处）
- 信息化处
- 关心下一代工作委员会
教辅机构，直属单位及其他
- 工程研究院
- 继续教育学院
- 图书馆
- 后勤处（后勤集团）
- 资产经营企业
- 睿安房地产开发企业
教学机构
- 冶金工程学院
- 材料科学与工程学院
- 化学与化工学院
- 机械工程学院
- 电气与信息工程学院
- 计算机科学与技术学院
- 建筑工程学院
- 能源与环境学院
- 管理科学与工程学院
- 商学院
- 公共管理与法学院
- 微电子与数据科学学院
- 外国语学院
- 艺术与设计学院
- 马克思主义学院
- 体育部
- 工程实践与创新教育中心（创新教育学院）
研究机构
- 马鞍山大学科技园
- 冶金减排与资源综合利用教育部重点实验室
- 冶金工程与资源综合利用安徽省重点实验室
- 企业治理与运营研究中心
- 现代分析测试中心
- 大学生思想政治教育与管理研究中心
- 分子工程与应用化学研究中心
- 现代表界面工程研究中心
- 冶金资源洁净高效利用省级协同创新中心
- 生物化工研究中心
- 生物膜法水质净化及利用技术教育部工程研究中心
- 安徽创新驱动发展研究院
- 先进金属材料绿色制备与表面技术教育部重点实验室
- 煤清洁转化与高值化利用安徽省重点实验室
- 特种重载机器人安徽省重点实验室
